Net als bij microsatellieten (STRs) is de basis hetzelfde. Echter, meer genetische markers worden getest omdat de informatie per marker voor een SNP lager is in vergelijking met een microsatelliet.
De genetische variatie die aanwezig is in een dier, is afkomstig van beide ouders. De helft van de variatie is afkomstig van de vader, terwijl de andere helft afkomstig is van de moeder.
Voor verificatie van de afstamming worden meestal 200 tot 400 genetische kenmerken gevisualiseerd. In dit proces wordt de werkelijke genetische samenstelling (A, C, G of T) gemeten. De samenstelling/variant bij een nakomeling moet overeenkomen met de samenstelling/variant bij de moeder en vader die ter vergelijking zijn verstrekt. In twee voorbeelden wordt getoond hoe de basisregels in ouderschapsverificatie worden toegepast.
Marker |
Nakomeling |
Moeder |
Vader |
SNP01 |
AT |
AA |
TT |
SNP02 |
GC |
GC |
CC |
SNP03 |
TT |
CT |
TT |
SNP04 |
AC |
AC |
AC |
SNP05 |
CC |
CC |
CT |
SNP06 |
CT |
CC |
CT |
In de bovenstaande tabel is een voorbeeld gegeven van een juiste afstamming. In deze tabel wordt het DNA van drie dieren getoond: een nakomeling (linker kolom), een potentiële moeder (middelste kolom) en een potentiële vader (rechter kolom). In elke regel wordt een genetische variant getoond. In dit geval zijn alle varianten die bij de nakomeling aanwezig zijn ook aanwezig bij de ouders: de afstamming correct is.
Marker |
Nakomeling |
Moeder |
Vader |
SNP01 |
AA |
AA |
TT |
SNP02 |
GC |
GC |
CC |
SNP03 |
CC |
CT |
TT |
SNP04 |
AC |
AC |
AC |
SNP05 |
CC |
CC |
CT |
SNP06 |
CT |
CC |
CT |
In de tweede tabel is een voorbeeld gegeven waarbij de afstamming niet correct is. In deze tabel wordt het DNA van drie dieren getoond: een nakomeling (linker kolom), een potentiële moeder (middelste kolom) en een potentiële vader (rechter kolom). In elke regel wordt een genetische variant getoond. In dit geval zijn diverse varianten aanwezig bij de nakomeling die niet aanwezig zijn bij de ouders: de afstamming is niet correct.
Indien 200 tot 400 verschillende genetische fragmenten zijn beoordeeld, wordt de kans zeer klein dat een onjuiste afstamming niet wordt gedetecteerd. De genetische fragmenten die worden gebruikt voor de verificatie van de afstamming en identificatie bevatten geen informatie over eigenschappen zoals kleur en kwaliteit van een dier, plant of mens, aangezien de gekozen fragmenten niet-informatief zijn.